Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trem1Q9JKE2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms