Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scamp5Q9JKD3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms