Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Uchl3Q9JKB1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.4 ms