Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Efcc1Q9JJF6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Efcc1Q9JJF6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Efcc1Q9JJF6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms