Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FliiQ9JJ28 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FliiQ9JJ28 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FliiQ9JJ28 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FliiQ9JJ28 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FliiQ9JJ28 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FliiQ9JJ28 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FliiQ9JJ28 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FliiQ9JJ28 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FliiQ9JJ28 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FliiQ9JJ28 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FliiQ9JJ28 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FliiQ9JJ28 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FliiQ9JJ28 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FliiQ9JJ28 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FliiQ9JJ28 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FliiQ9JJ28 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms