Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Copb1Q9JIF7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms