Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc40a1Q9JHI9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc40a1Q9JHI9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms