Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cxcl11Q9JHH5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cxcl11Q9JHH5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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