Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Timp4Q9JHB3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Timp4Q9JHB3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms