Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET78

Jph2, Junctophilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph2Q9ET78 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Jph2Q9ET78 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jph2Q9ET78 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jph2Q9ET78 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Jph2Q9ET78 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Jph2Q9ET78 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jph2Q9ET78 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms