Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cmtm7Q9ESD6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmtm7Q9ESD6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms