Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc4Q9ES56 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc4Q9ES56 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc4Q9ES56 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc4Q9ES56 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc4Q9ES56 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc4Q9ES56 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc4Q9ES56 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc4Q9ES56 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc4Q9ES56 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc4Q9ES56 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc4Q9ES56 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms