Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3bQ9ES34 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ube3bQ9ES34 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms