Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms