Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ripk4Q9ERK0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ripk4Q9ERK0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk4Q9ERK0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms