Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERI2

Rab27a, Ras-related protein Rab-27A, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27aQ9ERI2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab27aQ9ERI2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab27aQ9ERI2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rab27aQ9ERI2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms