Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERC3

Sertad3, SERTA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sertad3Q9ERC3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sertad3Q9ERC3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms