Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tfip11Q9ERA6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tfip11Q9ERA6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tfip11Q9ERA6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tfip11Q9ERA6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms