Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpcn1Q9EQJ0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpcn1Q9EQJ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpcn1Q9EQJ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms