Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r44Q9EQ47 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms