Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Senp3Q9EP97 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Senp3Q9EP97 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms