Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3fQ9DCH4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3fQ9DCH4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms