Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GabarapQ9DCD6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabarapQ9DCD6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabarapQ9DCD6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabarapQ9DCD6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabarapQ9DCD6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabarapQ9DCD6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabarapQ9DCD6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabarapQ9DCD6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabarapQ9DCD6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabarapQ9DCD6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GabarapQ9DCD6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms