Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ftsj3Q9DBE9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ftsj3Q9DBE9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms