Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
3110070M22RikQ9DAQ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
3110070M22RikQ9DAQ7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
3110070M22RikQ9DAQ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
3110070M22RikQ9DAQ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
3110070M22RikQ9DAQ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
3110070M22RikQ9DAQ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
3110070M22RikQ9DAQ7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
3110070M22RikQ9DAQ7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
3110070M22RikQ9DAQ7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
3110070M22RikQ9DAQ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
3110070M22RikQ9DAQ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
3110070M22RikQ9DAQ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
3110070M22RikQ9DAQ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
3110070M22RikQ9DAQ7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
3110070M22RikQ9DAQ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms