Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc89Q9DA73 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms