Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9DA42 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9DA42 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9DA42 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9DA42 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9DA42 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9DA42 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9DA42 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9DA42 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9DA42 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9DA42 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9DA42 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9DA42 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9DA42 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9DA42 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9DA42 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9DA42 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9DA42 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9DA42 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9DA42 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9DA42 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9DA42 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9DA42 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9DA42 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DA42 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DA42 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DA42 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DA42 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DA42 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DA42 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DA42 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DA42 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DA42 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DA42 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DA42 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DA42 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DA42 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DA42 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9DA42 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Q9DA42 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9DA42 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9DA42 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9DA42 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9DA42 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9DA42 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9DA42 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9DA42 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9DA42 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9DA42 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9DA42 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9DA42 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9DA42 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9DA42 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9DA42 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9DA42 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9DA42 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9DA42 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9DA42 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9DA42 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9DA42 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9DA42 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9DA42 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9DA42 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9DA42 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9DA42 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9DA42 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9DA42 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9DA42 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9DA42 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9DA42 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9DA42 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9DA42 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9DA42 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9DA42 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9DA42 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9DA42 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9DA42 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9DA42 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9DA42 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9DA42 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9DA42 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9DA42 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9DA42 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9DA42 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9DA42 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9DA42 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9DA42 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9DA42 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9DA42 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9DA42 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9DA42 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9DA42 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9DA42 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9DA42 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9DA42 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9DA42 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9DA42 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9DA42 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9DA42 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9DA42 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms