Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smco2Q9DA21 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smco2Q9DA21 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms