Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efhc1Q9D9T8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Efhc1Q9D9T8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms