Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N8

Pradc1, Protease-associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pradc1Q9D9N8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pradc1Q9D9N8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pradc1Q9D9N8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms