Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Q9D9H8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Q9D9H8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Q9D9H8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Q9D9H8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Q9D9H8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Q9D9H8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Q9D9H8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Q9D9H8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Q9D9H8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Q9D9H8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Q9D9H8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Q9D9H8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Q9D9H8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Q9D9H8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Q9D9H8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Q9D9H8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Q9D9H8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Q9D9H8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms