Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Speer4bQ9D9F7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Speer4bQ9D9F7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Speer4bQ9D9F7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms