Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco5aQ9D9D5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms