Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc70Q9D9B0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc70Q9D9B0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc70Q9D9B0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc70Q9D9B0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc70Q9D9B0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc70Q9D9B0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc70Q9D9B0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc70Q9D9B0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc70Q9D9B0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc70Q9D9B0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms