Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnot8Q9D8X5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot8Q9D8X5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms