Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8Q6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms