Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf13cQ9D8D0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms