Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arpc5lQ9D898 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arpc5lQ9D898 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Arpc5lQ9D898 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arpc5lQ9D898 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arpc5lQ9D898 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arpc5lQ9D898 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arpc5lQ9D898 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arpc5lQ9D898 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arpc5lQ9D898 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arpc5lQ9D898 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arpc5lQ9D898 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arpc5lQ9D898 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arpc5lQ9D898 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms