Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn22Q9D7U6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn22Q9D7U6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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