Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nop56Q9D6Z1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nop56Q9D6Z1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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