Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pfn4Q9D6I3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfn4Q9D6I3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms