Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3a3Q9D554 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3a3Q9D554 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms