Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4931423N10RikQ9D4J9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms