Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul2Q9D4H8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cul2Q9D4H8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms