Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lonrf3Q9D4H7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lonrf3Q9D4H7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms