Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.27■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms