Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4cQ9D3F6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms