Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp35Q9D384 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snrnp35Q9D384 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms