Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vps33aQ9D2N9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps33aQ9D2N9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms