Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl53Q9D1H8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms