Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lmbr1lQ9D1E5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmbr1lQ9D1E5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms